16s微生物測序+代謝組
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16S rDNA擴增子測序:采用IlluminaMiSeq/NovaSeq平臺對群落DNA片段進行雙端(Paired-end)測序,對rRNA基因可變區(單個或連續的多個)或特定基因片段進行PCR擴增,然后對高變區進行測序,進行OTU(Operational Taxonomic Units)序列分析以及菌種鑒定。利用β多樣性進行組間分析,找出在不同分類水平上的分組間豐度變化差異顯著的物種。
非靶代謝組學:基于超高效液相色譜-Q-TOFMS的非靶向代謝組學,結合數據依賴采集方式對樣本進行全譜分析。利用多維統計分析OPLS-DA的VIP值和單變量統計分析的p值找出分組間豐度變化差異顯著的代謝物。
關聯分析:關聯分析是數據深入挖掘的一種方式,主要用來發現隱藏在數據集中的關聯性或相關性。16S與代謝的關聯分析主要是基于統計學的算法來發現顯著性差異的菌群與顯著性差異的代謝物之間的關聯。
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1. 高精度成熟平臺,數據豐富可靠;
2. 16s微生物測序與代謝組測定技術成熟,可以分別產生全面的分析報告;
3. 聯合分析可以打通菌群多樣性與功能。通過對不同層面的表達水平相關性的分析,有利于完成關鍵菌群的篩選;
4. 專業生信團隊,嚴格質控,嚴謹分析,支持個性化定制分析。
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?實驗路線:

數據分析路線:

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?16s微生物測序送樣要求:

送樣應保證新鮮、足量,提供三次實驗所需用量。具體提取方法和寄送條件,請咨詢技術支持或銷售工程師。
代謝組學送樣要求:
所有樣品應避免反復凍融。如需詳細樣品準備及提取步驟,或其他樣品類型,請咨詢技術支持或銷售工程師。額外要求:16s微生物測序以及代謝組檢測送樣的分組及樣品名應盡量保持一致,便于聯合分析。
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16s微生物測序:illumina MiSeq臺式DNA測序儀,或illumina NovaSeq? X Plus測序儀。
代謝組:TripleTOF?5600+ LC-MS/MS液質聯用飛行時間質譜系統。
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