16s微生物測(cè)序
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在以16S/18SrRNA基因或ITS區(qū)域?yàn)槟繕?biāo)序列的菌群多樣性組成譜測(cè)序研究中,傳統(tǒng)的二代測(cè)序平臺(tái)一般只能對(duì)單個(gè)或連續(xù)的兩三個(gè)可變區(qū)序列進(jìn)行測(cè)序分析,通常情況下無(wú)法獲得rRNA基因全長(zhǎng)序列的信息,往往難以在屬、種甚至菌株等精細(xì)水平識(shí)別測(cè)得的序列。而三代測(cè)序技術(shù),通過(guò)利用PacBio平臺(tái)的SMRT單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA序列實(shí)現(xiàn)單分子級(jí)別的超長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序,單堿基測(cè)序的準(zhǔn)確率也大大提高。在種甚至菌株等精細(xì)水平上解析菌群多樣性和組成譜,深入獲取微生物群落的精細(xì)組成信息,以便在預(yù)測(cè)微生物群落的潛在代謝功能、宏基因組測(cè)序研究、鑒定與表型/組間差異相關(guān)的關(guān)鍵物種等方面獲得可靠的數(shù)據(jù)支持。
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1. 自動(dòng)化、專業(yè)、完善的DNA提取擴(kuò)增體系和樣本前處理流程;
2. 擁有PacBio RSII和Sequel兩種單分子實(shí)時(shí)測(cè)序平臺(tái),提供一站式測(cè)序服務(wù);
3. 多個(gè)物種注釋數(shù)據(jù)庫(kù)(Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM等),優(yōu)化物種的分類鑒定;
4. 專業(yè)科研團(tuán)隊(duì)全面支持,報(bào)告結(jié)果圖形均為發(fā)表級(jí),可個(gè)性化定制;
5. 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富,擁有涵蓋水樣、活性污泥、土壤、排泄物、體液、組織等各類樣本的全套流程。
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實(shí)驗(yàn)路線:

數(shù)據(jù)分析路線:

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微生物組與環(huán)境互作關(guān)系的研究;
微生物組與宿主共生關(guān)系的研究;
微生物組在臨床醫(yī)學(xué)和精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用;
微生物組在發(fā)酵工藝、食品加工/檢測(cè)等行業(yè)的應(yīng)用。
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送樣應(yīng)保證新鮮、足量,提供三次實(shí)驗(yàn)所需用量。具體提取方法和寄送條件,請(qǐng)咨詢技術(shù)支持或銷售工程師。
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illumina NovaSeq? X Plus測(cè)序儀。
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