ITS測序
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ITS測序是指內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(Internal Transcribed Spacer)的測序。真核生物的rRNA基因組包括18S、5.8S和28S rRNA,作為一個轉(zhuǎn)錄單元存在。轉(zhuǎn)錄后,這些rRNA經(jīng)過剪接加工,去除兩個內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS區(qū))和5.8S rRNA。
ITS區(qū)包含這些內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)和5.8S rRNA,通常用于真菌的分類鑒定。在真核生物分子鑒定中,18S rRNA是常用的標(biāo)準(zhǔn),但I(xiàn)TS區(qū)在真菌分類中提供了比18S rRNA更為精確的結(jié)果。通過測序得到的ITS序列與已知的真菌ITS序列比較,可以準(zhǔn)確識別待測真菌的種屬。
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1. 價格低廉,技術(shù)成熟;
2. 樣本處理經(jīng)驗(yàn)豐富,涵蓋各類動植物組織細(xì)胞、微生物、外泌體等的成熟流程;
3. 優(yōu)質(zhì)平臺:Illunima平臺,質(zhì)控嚴(yán)格,數(shù)據(jù)質(zhì)量高;
4. 專業(yè)服務(wù):豐富翔實(shí)的分析報(bào)告,強(qiáng)大的生信及管理團(tuán)隊(duì)進(jìn)行售后,免費(fèi)使用云平臺工具進(jìn)行個性化分析。
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(1)環(huán)境微生物生態(tài)學(xué):微生物多樣性測序有助于分析各種環(huán)境(如土壤、水體、海洋和空氣)中微生物群落的結(jié)構(gòu)、組成和動態(tài)變化。
(2)醫(yī)學(xué)微生物學(xué):通過微生物多樣性測序可以研究人體、動物和植物不同部位的微生物群落,探討其與宿主健康及疾病的關(guān)系,對疾病診斷、藥物研發(fā)和預(yù)防具有重要意義。
(3)食品微生物學(xué):微生物多樣性測序可以揭示食品樣本中的微生物群落,從而監(jiān)控食品質(zhì)量、安全性以及創(chuàng)新食品生產(chǎn)技術(shù)的進(jìn)展。
(4)生物工藝:在生物制藥、釀造和發(fā)酵領(lǐng)域,微生物多樣性測序有助于優(yōu)化和監(jiān)控微生物菌株,提升生產(chǎn)效率和產(chǎn)品質(zhì)量。
(5)生態(tài)學(xué):分析野生動植物及生態(tài)系統(tǒng)中的微生物群落,有助于理解其與宿主的相互作用,并支持物種保護(hù)和生態(tài)系統(tǒng)管理。
(6)系統(tǒng)發(fā)育與分類學(xué):微生物多樣性測序數(shù)據(jù)用于微生物的分類、系統(tǒng)發(fā)育及進(jìn)化關(guān)系研究,有助于解析物種間的遺傳關(guān)系。
(7)生態(tài)毒理學(xué):研究微生物群落對環(huán)境毒性的響應(yīng),能夠評估環(huán)境污染對生態(tài)系統(tǒng)健康的影響,為環(huán)境保護(hù)提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)。
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1. 建議采用Rnase-free帶螺紋的1.5ml或2ml EP管保存;
2. 采用泡沫盒密封包裝,并加入足夠量的干冰;
3. 所有樣品應(yīng)避免反復(fù)凍融。如需詳細(xì)樣品準(zhǔn)備及提取步驟,或其他樣品類型,請咨詢技術(shù)支持或銷售工程師。
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?illumina NovaSeq? X Plus測序儀。
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